Aynı zamanda çekirdekleri de lif ve protein bakımından çokca zengindir. Nasıl tüketebilirim diyorsanız; kurutarak çekirdek gibi çitleyebilirsiniz.
Güçlü bir antioksidan kaynağı olan karpuz çekirdeklerini acıkmayı engeller. Sabahları yoğurdun içine biraz karıştırıp bu şekilde tüketebiliriz. Böylelikle bir sonraki öğünde daha kontrollü yemek yemiş olursunuz.
Karpuz çekirdeğinde bulunan folik asit sindirim sisteminin düzenlenmesine yardımcı olur. Bunun için karpuz çekirdeklerini kaynatıp içebilir hatta yeşilçayla beraber karışım yaparak tüketebilirsiniz.
Magnezyum açısından zengin olan çekirdek, metabolizma dengesini korur. 4 gr. karpuz çekirdeğinde 21 mg. magnezyum bulunur. Magnezyum sadece metabolizmaya etki etmekle kalmaz aynı zamanda tansiyon, ve sinir sistemini de olumlu anlamda etkiler.